甲烷本身对人体无毒害，属“单纯窒息性”气体。空气中甲烷浓度达到25%~30%时出现头晕、呼吸加速、运动失调的症状。小鼠吸入（42%浓度）会导致60min麻醉。

     对吸入甲烷气体患者的急救，首先应该脱离污染区，安置休息，如呼吸失调，进行输氧；如呼吸停止，立即进行人工呼吸，并送医院抢救。
 

    甲烷为易燃易爆气体，在空气中的自燃，所以，空气中的甲烷的爆炸浓度较低。因而，无论是生产现场，还是贮运和使用环境，均应按相应规范配置防火防爆安全设施。甲烷为“永久气体”，用高压气瓶充装甲烷时，应严格按照国家标准GB50999《钢质无缝气瓶》和《气瓶安全监察规程》的规定检验和管理。气体甲烷的充装则应按照GB14194《永久气体充装规定》的要求进行操作。

    高纯甲烷与所有低温液体一样，直接接触液体甲烷将引起冻伤。液体甲烷外溢并突然大容量蒸发还会造成环境缺氧，并有可能和空气一起形成爆炸混合物，引发燃烧和爆炸事故。在处理有可能受泄漏的低温可燃气体或液体浸泡的多孔物质（如珠光砂，吸附剂、保温泡沫等）时，应特别小心，必须复热到常温，用惰性气体将多孔材料内吸附的可燃气体置换干净方能动火。